Genetics of progression of pleomorphic xanthoastrocytoma (PXA) in the pediatric population
Notice bibliographique
Résumé
Recent publications suggest that with time, PXAs, rare low grade astrocytomas of children and young adults, may acquire anaplastic features and progress to malignancy with a prognosis similar to high grade astrocytomas. As malignant progression of low grade astrocytomas is rare in children, we sought to uncover the genetic changes that underlie this transformation. A search of the databases at our institution (1985–2007) identified 7 patients with a primary diagnosis of PXA. Most had multiple recurrences, with two fatalities. Extracted DNA was hybridized onto 500K SNP mapping gene arrays (Affymetrix) and gene copy‐number changes identified (dCHIP). Analysis of copy‐number changes at first presentation showed few alterations, mainly corresponding to genes within the Wnt/Cadherin pathways. However, with recurrences, the number of genes with copy‐number changes increased and other pathways implicated in cell proliferation, motility and invasiveness became modified, with prominent involvement of the integrin, Ras, and EGFR pathways. These data show that recurring PXAs acquire cumulative and progressive genetic changes that contribute to their rapid growth and increasing invasiveness and thus their less favorable outcome. Further, our experience supports the idea that in the pediatric population, PXAs are prone to recurrences and do not behave as typical low grade astrocytomas. Funding: CIHR.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».