A genome-wide screen of Epstein-Barr virus proteins that modulate host SUMOylation identifies a SUMO E3 ligase conserved in herpesviruses
Notice bibliographique
Résumé
Many cellular processes pertinent for viral infection are regulated by the addition of small ubiquitin-like modifiers (SUMO) to key regulatory proteins, making SUMOylation an important mechanism by which viruses can commandeer cellular pathways. Epstein-Barr virus (EBV) is a master at manipulating of cellular processes, which enables life-long infection but can also lead to the induction of a variety of EBV-associated cancers. To identify new mechanisms by which EBV proteins alter cells, we screened a library of 51 EBV proteins for global effects on cellular SUMO1 and SUMO2 modifications (SUMOylation), identifying several proteins not previously known to manipulate this pathway. One EBV protein (BRLF1) globally induced the loss of SUMOylated proteins, in a proteasome-dependent manner, as well as the loss of promeylocytic leukemia nuclear bodies. However, unlike its homologue (Rta) in Kaposi's sarcoma associated herpesvirus, it did not appear to have ubiquitin ligase activity. In addition we identified the EBV SM protein as globally upregulating SUMOylation and showed that this activity was conserved in its homologues in herpes simplex virus 1 (HSV1 UL54/ICP27) and cytomegalovirus (CMV UL69). All three viral homologues were shown to bind SUMO and Ubc9 and to have E3 SUMO ligase activity in a purified system. These are the first SUMO E3 ligases discovered for EBV, HSV1 and CMV. Interestingly the homologues had different specificities for SUMO1 and SUMO2, with SM and UL69 preferentially binding SUMO1 and inducing SUMO1 modifications, and UL54 preferentially binding SUMO2 and inducing SUMO2 modifications. The results provide new insights into the function of this family of conserved herpesvirus proteins, and the conservation of this SUMO E3 ligase activity across diverse herpesviruses suggests the importance of this activity for herpesvirus infections.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».