Transcriptomic Analysis on the Regulation of Tomato Ripening by the Ethylene Inhibitor 1-methylcyclopropene
Notice bibliographique
Résumé
Tomato is a climacteric fruit whose ripening is regulated by the plant hormone ethylene. 1-methylcyclopropene (1-MCP) is a competitive ethylene inhibitor that can delay the fruit ripening process. To understand the molecular mechanism of how 1-MCP inhibits tomato fruit ripening, transcriptomics (RNA-Seq) was used to identify genes that were differentially expressed in 1-MCP-treated (Day 1) tomato fruits. Of the 35340 genes in the tomato genome, about 50% were expressed with 1-MCP treatment. There were 5683 genes identified as significantly differentially expressed. Quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) assays were used to validate the RNA-Seq data. Our results showed that 1-MCP treatment resulted in the down-regulation of fruit ripening-related genes, including genes involved in ethylene synthesis, signal transduction and carotenoid biosynthesis. Our results provide insight at the whole genome level regarding gene regulation by 1-MCP during fruit ripening. Understanding the molecular basis of 1-MCP inhibition on tomato ripening may help farmers and food processors to better use 1-MCP in agriculture and food industry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».