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Enregistrement W2821972515 · doi:10.5539/jps.v7n2p49

Transcriptomic Analysis on the Regulation of Tomato Ripening by the Ethylene Inhibitor 1-methylcyclopropene

2018· article· en· W2821972515 sur OpenAlexvenueno aff
Jamshed Bobokalonov, Yanhong Liu, Tasnuva Shahrin, LinShu Liu

Notice bibliographique

RevueJournal of Plant Studies · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePostharvest Quality and Shelf Life Management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Department of Agriculture
Mots-clésRipeningClimactericTranscriptomeEthylene1-MethylcyclopropeneRNA-SeqGeneBiologyPlant hormoneGene expressionBiochemistryHorticultureGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Tomato is a climacteric fruit whose ripening is regulated by the plant hormone ethylene. 1-methylcyclopropene (1-MCP) is a competitive ethylene inhibitor that can delay the fruit ripening process. To understand the molecular mechanism of how 1-MCP inhibits tomato fruit ripening, transcriptomics (RNA-Seq) was used to identify genes that were differentially expressed in 1-MCP-treated (Day 1) tomato fruits. Of the 35340 genes in the tomato genome, about 50% were expressed with 1-MCP treatment. There were 5683 genes identified as significantly differentially expressed. Quantitative reverse transcription PCR (qRT-PCR) assays were used to validate the RNA-Seq data. Our results showed that 1-MCP treatment resulted in the down-regulation of fruit ripening-related genes, including genes involved in ethylene synthesis, signal transduction and carotenoid biosynthesis. Our results provide insight at the whole genome level regarding gene regulation by 1-MCP during fruit ripening. Understanding the molecular basis of 1-MCP inhibition on tomato ripening may help farmers and food processors to better use 1-MCP in agriculture and food industry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,732
Score d'incertitude au seuil0,227

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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