Legionella pneumophila effector Lem4 is a membrane-associated protein tyrosine phosphatase
Notice bibliographique
Résumé
injects over 300 effector proteins into the host cell cytosol. The Lem4 effector (lpg1101) consists of two domains: an N-terminal haloacid dehalogenase (HAD) domain with unknown function and a C-terminal phosphatidylinositol 4-phosphate-binding domain that anchors Lem4 to the membrane of early LCVs. Herein, we demonstrate that the HAD domain (Lem4-N) is structurally similar to mouse MDP-1 phosphatase and displays phosphotyrosine phosphatase activity. Substrate specificity of Lem4 was probed using a tyrosine phosphatase substrate set, which contained a selection of 360 phosphopeptides derived from human phosphorylation sites. This assay allowed us to identify a consensus pTyr-containing motif. Based on the localization of Lem4 to lysosomes and to some extent to plasma membrane when expressed in human cells, we hypothesize that this protein is involved in protein-protein interactions with an LCV or plasma membrane-associated tyrosine-phosphorylated host target.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».