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Enregistrement W2840962514 · doi:10.5539/jmbr.v8n1p61

Comparative Study of p40 Gene Expression of Mycoplasma Agalactiae Isolated from Iranian Provinces

2018· article· en· W2840962514 sur OpenAlexvenueno aff
Fereshteh Yavari, Seyed Ali Pourbakhsh, Hossein Goudarzi, Ramezan Ali Khavari-Nejad

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Biology Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueMicrobial infections and disease research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesRazi Vaccine and Serum Research Institute
Mots-clésBiologyMycoplasmaMicrobiologyPolyclonal antibodiesGenePathogenVirologyHomology (biology)Fusion proteinSequence analysisRecombinant DNAPlasmidAntibodyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycoplasma agalactiae pathogen is the main cause of agalactia in small ruminants and as such, results in some economic losses in Iran. Contagious agalactia disease should be regarded as a syndrome, caused by various Mycoplasmas which infect several organs. In the present study, 30 suspected samples from 11 provinces of Iran were isolated from mammary gland, joint and eyes of sheep and goats and subjected to genus and species detection via PCR technique for 2 genes. These Mycoplasma strains and three Iranian vaccinal strains of Mycoplasma agalactiae were submitted to sequence analysis of a surface lipoprotein called p40 protein. Based on a comparative study between Iranian strains and PG2 Spanish strain of Mycoplasma agalactiae, most Iranian strains presented 97% homology, whereas some strains showed 80-88% and three vaccinal strains were associated with 99% homology. According to PCR and bioinformatics analysis outcomes, 6 provinces of Iran were recognized as infection areas with different expressions of this effecter protein, suggesting that finding the individual characteristics of a particular effecter may require empirical testing for vaccination. Finally, the selected sequence of p40 gene was cloned into pGEMB1cloning vector and subsequently expressed in Escherichia coli by pET-22b+ expression plasmid under the control of the T7 promoter. The expression of this fusion protein was absorbed and confirmed by SDS-PAGE. The recombinant P40 protein was expressed with a molecular mass of 37 kDa on SDS-PAGE. The sera taken from rabbits infected with Mycoplasma agalactiae produced polyclonal antibody which was then used for westernblotting. The rabbits were bled 10 days after the booster immunization using cardiac puncture. Significantly, the use of recombinant specific antigens instead of other tools for diagnosis of a disease could improve the discrimination and separation of positive and negative animals in the area under investigation and therefore, it can be applied to control infected animals and reduce economic losses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,772

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,051
Tête enseignante GPT0,396
Écart entre enseignants0,345 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
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