Clonal distribution of an atypical MRP+, EF*, and suilysin+ phenotype of virulent Streptococcus suis serotype 2 strains in Brazil.
Notice bibliographique
Résumé
Streptococcus suis is considered one of the most important bacterial swine pathogens worldwide. The distribution of the 35 described serotypes in diseased animals may vary in different regions. Data regarding S. suis isolation from pigs in South America is not available. In the present study, 51 isolates of S. suis recovered in pure culture or as the predominant species from diseased animals in Brazil, were analyzed. These isolates were classified as serotypes 2 (58.8%), 3 (21.5%), 7 (13.7%), 1 (3.9%), and 14 (2%). Serotype 2 isolates were further studied for their production of virulence-related proteins muramidase-released protein (MRP), extracellular factor (EF), and suilysin. In addition, the genetic diversity was studied by randomly amplified polymorphic DNA. All but 1 of the serotype 2 isolates showed a clonal distribution of an atypical phenotype (MRP+, EF*, suilysin+), different from the known European (MRP+, EF+, suilysin+), and North American (MRPv, EF-, suilysin-), phenotypes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».