Ex vivo HIV entry into blood CD4+ T cells does not predict heterosexual HIV acquisition in women
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: A blood-based assay that could quantify HIV susceptibility would be very valuable for HIV prevention research. Previously, we developed and validated an ex vivo, flow-based, HIV entry assay to assess genital HIV susceptibility in endocervical CD4+ T cells. METHODS: Here we assessed whether this tool could be used to predict HIV risk using blood-derived CD4+ T cells in a rigorously-blinded, nested case-control study using blood samples collected from high-risk, HIV-uninfected South African women enrolled in the CAPRISA 004 clinical trial. Cases, subsequently acquiring HIV were sampled prior to HIV infection and compared with controls, who remained HIV-uninfected. The primary endpoint was ex vivo entry of a CCR5-tropic HIV founder virus into blood CD4+ T cells. Secondary endpoints included HIV entry into CD4+ central (TCM) and effector (TEM) memory T cells, and into CD4+ T cell subsets expressing CCR5, CD69, CCR6, α4β1 or α4β7. RESULTS: Compared to bulk CD4+ T cells (4.9% virus entry), CD4+ T cells expressing CCR5, CCR6 or α4β1 and TEM were highly susceptible (15.5%, 8.8%, 8.2% and 10.8% entry, respectively, all p<0.0001), while TCM, CD69+ or α4β7+ CD4+ cells were moderately susceptible (6.4%, 6.0% and 5.8% respectively, p ≤ 0.003). While the proportion of the aforementioned highly susceptible cells correlated with overall virus entry into CD4+ T cells within an individual (r = 0.68, 0.47, 0.67, and 0.60 respectively, p<0.0001), blood virus entry did not predict subsequent mucosal HIV acquisition after controlling for sexual behaviour and condom use (OR 0.92, 95% CI 0.77-1.11, p = 0.40). CONCLUSIONS: Although virus entry identified several previously known highly susceptible cellular HIV targets, blood HIV entry did not predict subsequent heterosexual HIV acquisition. Assessment of mucosal HIV susceptibility may require sampling at the site of HIV exposure.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».