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Enregistrement W2858266604 · doi:10.1139/gen-2018-0043

Intraspecific mitogenomics of three marine species-at-risk: Atlantic, spotted, and northern wolffish (<i>Anarhichas</i> spp.)

2018· article· en· W2858266604 sur OpenAlexaffvenue
Linda A. Lait, Steven M. Carr

Notice bibliographique

RevueGenome · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of GuelphMemorial University of Newfoundland
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhylogeographyEcologyIntraspecific competitionGlacial periodGenetic structureSympatric speciationPopulationHaplogroupSpecies complexZoologyGenetic variationPhylogeneticsPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

High-resolution mitogenomics of within-species relationships can answer such phylogeographic questions as how species survived the most recent glaciation, as well as identify contemporary factors such as physical barriers, isolation, and gene flow. We examined the mitogenomic population structure of three at-risk species of wolffish: Atlantic (Anarhichas lupus), spotted (A. minor), and northern (A. denticulatus). These species are extensively sympatric across the North Atlantic but exhibit very different life history strategies, a combination that results in concordant and discordant patterns of genetic variation and structure. Wolffish haplogroups were not structured geographically: Atlantic and spotted wolffish each comprised three shallow clades, whereas northern wolffish comprised two deeper but unstructured lineages. We suggest that wolffish species survived in isolation in multiple glacial refugia, either refugia within refugia (Atlantic and spotted wolffish) or more distant refugia (northern wolffish), followed by secondary admixture upon post-glacial recolonisation of the North Atlantic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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