MétaCan
← tous les travaux

KBase: The United States Department of Energy Systems Biology Knowledgebase

2018· article· en· 1 670 citations· W2859249641 sur OpenAlex· 10.1038/nbt.4163

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Résumé

The U.S. Department of Energy Systems Biology Knowledgebase (KBase, http://kbase.us) is an open-source software and data platform designed to tackle the grand challenge of systems biology—predicting and designing biological function at scales ranging from the biomolecular to the ecological. KBase is available for anyone to use, and enables researchers to collaboratively generate, test, compare, and share hypotheses about biological functions; perform large analyses on scalable computing infrastructure; and combine experimental evidence and conclusions to model plant and microbial physiology and community dynamics. The KBase platform has extensible analytical capabilities that currently include (meta)genome assembly, annotation, comparative genomics, transcriptomics, and metabolic modeling; a web-based user interface that supports building, sharing, and publishing reproducible and well-annotated analyses with integrated data; and a software development kit that enables the community to add functionality to the system.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Nature Biotechnology
Thématique
Health, Environment, Cognitive Aging
Domaine
Environmental Science
Établissements canadiens
Organismes subventionnaires
Brookhaven National LaboratoryOffice of ScienceCarl R. Woese Institute for Genomic BiologyStony Brook UniversityYork UniversityNew York University ShanghaiUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterBiological and Environmental ResearchJohns Hopkins UniversityU.S. Department of Energy
Mots-clés
Computational biologyBiology
Résumé présent dans OpenAlex
oui