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Enregistrement W2876339530 · doi:10.1371/journal.pone.0200552

Compositional, ultrastructural and nanotechnological characterization of the SMA strain of Saccharomyces pastorianus: Towards a more complete fermentation yeast cell analysis

2018· article· en· W2876339530 sur OpenAlexafffund
Greg Potter, Chantel W. Swart, Pieter W. J. van Wyk, Mart‐Mari Duvenhage, E. Coetsee, H.C. Swart, Suzanne M. Budge, R. Alex Speers

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueRadioactive element chemistry and processing
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesDivision of Materials ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversiteit van die VrystaatDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaNational Research Council CanadaFonds National de la Recherche Luxembourg
Mots-clésFermentationUltrastructureYeastStrain (injury)Saccharomyces cerevisiaeBiophysicsTransmission electron microscopyChemistryIntracellularBiologyCell biologyBiochemistryMaterials scienceNanotechnologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nano scanning Auger microscopy (NanoSAM) and time-of-flight secondary ion mass spectrometry (TOF-SIMS) have been used in materials science research for some time, but NanoSAM, in particular, has only recently been applied to biological specimens. Here, the first concurrent utilization of NanoSAM, TOF-SIMS and microscopic techniques for the examination of a standard beverage fermentation strain of Saccharomyces pastorianus uncovered the presence of intracellular networks of CO2 in fermenting cells. Respiring cells produced few bubbles and instead had large internal vacuolar structures. Transmission electron microscopy analysis also showed osmiophilic layers at the cell exterior of fermenting cells that became more prevalent with fermentation duration, while osmiophilic layers were largely absent in respiring cells. TOF-SIMS analysis showed a compositional difference at the exterior and interior of SMA cells and between fermenting and respiring cells. Fermenting cells also appeared to have different 3-OH oxylipin profiles compared to respiring cells based upon examination with immunofluorescence microscopy. The results of this work and further study using these materials science techniques will substantially enhance our understanding of the chemical, ultrastructural and metabolic changes that occur in fermentation yeasts.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission2
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