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Enregistrement W2883075326

Abstract 15379: Regulation of Long Non-Coding RNA Fingerprint by Cyclic Mechanical Stretch in Vascular Smooth Muscle Cells: Implications for Aortic Aneurysms

2016· article· en· W2883075326 sur OpenAlexaff
Laura-Eve Mantella, Krishna K. Singh, Paul Sandhu, Crystal Kantores, Azza Ramadan, Nadiya Khyzha, Adrian Quan, Mohammed Al‐Omran, Jason E. Fish, Robert E Jankov, Subodh Verma

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensToronto General HospitalSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVascular smooth muscleGene knockdownMedicineAngiotensin IILong non-coding RNACell biologyPathogenesisAnnexinDownregulation and upregulationAortic aneurysmApoptosisPathologyAortaInternal medicineBiologyGeneReceptorStainingSmooth muscleBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Emerging evidence suggests that long noncoding RNAs (lncRNAs) may be a cellular hub for the coordination of cellular processes involved in health and disease. Alterations in the characteristics of vascular smooth muscle cells (VSMCs), triggered largely by changes in mechanical stress, play a critical role in the pathophysiology of vascular diseases like aneurysms and hypertension. Hypothesis: LncRNAs are involved in mechanical stretch-induced changes in HASMCs. Methods: Total RNA was extracted with TRIzol. LncRNAs and mRNAs were profiled with the Arraystar Human LncRNA Microarray V3.0. Aneurysmal and non-aneurysmal samples were collected from patients undergoing aortic arch repair and the aortas of ApoE -/- mice infused for 4 weeks with angiotensin II or saline. Gene expression was quantified via qRT-PCR. For knockdown studies, HASMCs were transfected with 10 nM siLincRNA-p21 or 5 nM scrambled control (nM). Apoptosis was assessed using Annexin V/PI double staining. Results: Of the 30,586 human lncRNAs screened in HASMCs, 580 were differentially expressed (P -/- mice (N = 3, P Bax , Puma , Noxa , and Mdm2 under conditions of stretch (N = 3, P Conclusions: We describe the first transcriptome profile of stretch-induced changes in HASMCs. The data implicate lincRNA-p21 as a mechanoresponsive regulator of aneurysm formation in mice and humans, and provide novel insights into the regulatory switches governing aberrant VSMC remodeling, which may have importance in the pathogenesis of aneurysms and hypertension.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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