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Enregistrement W2883095167 · doi:10.1016/j.pbiomolbio.2018.07.005

A beginner's guide to understanding and implementing the genetic modification of zebrafish

2018· review· en· W2883095167 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProgress in Biophysics and Molecular Biology · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCRISPRZebrafishTranscription activator-like effector nucleaseGenome editingBiologyComputational biologyForward geneticsInsertional mutagenesisGenetic screenTransgenesisCas9Transposable elementGeneticsGeneGenomePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Zebrafish are a relevant and useful vertebrate model species to study normal- and patho-physiology, including that of the heart, due to conservation of protein-coding genes, organ system organisation and function, and efficient breeding and housing. Their amenability to genetic modification, particularly compared to other vertebrate species, is another great advantage, and is the focus of this review. A vast number of genetically engineered zebrafish lines and methods for their creation exist, but their incorporation into research programs is hindered by the overwhelming amount of technical details. The purpose of this paper is to provide a simplified guide to the fundamental information required by the uninitiated researcher for the thorough understanding, critical evaluation, and effective implementation of genetic approaches in the zebrafish. First, an overview of existing zebrafish lines generated through large scale chemical mutagenesis, retroviral insertional mutagenesis, and gene and enhancer trap screens is presented. Second, descriptions of commonly-used genetic modification methods are provided including Tol2 transposon, TALENs (transcription activator-like effector nucleases), and CRISPR/Cas9 (clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9). Lastly, design features of genetic modification strategies such as promoters, fluorescent reporters, and conditional transgenesis, are summarised. As a comprehensive resource containing both background information and technical notes of how to obtain or generate zebrafish, this review compliments existing resources to facilitate the use of genetically-modified zebrafish by researchers who are new to the field.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,984
Score d'incertitude au seuil0,833

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,405
Écart entre enseignants0,375 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle