Alternate life history phases of a common seaweed have distinct microbial surface communities
Notice bibliographique
Résumé
Macroalgal life histories are complex, often involving the alternation of distinct free-living life history phases that differ in morphology, longevity and ploidy. The surfaces of marine macroalgae support diverse microbial biofilms, yet the degree of microbial variation between alternate phases is unknown. We quantified bacterial (16S rRNA gene) and microeukaryote (18S rRNA gene) communities on the surface of the common intertidal seaweed, Mastocarpus spp., which alternates between gametophyte (foliose, haploid) and sporophyte (encrusting, diploid) life history phases. A large portion (97%) of bacterial taxa on the surface Mastocarpus was also present in samples from the environment, indicating that macroalgal surface communities are largely assembled from the surrounding seawater. Still, changes in the relative abundance of bacterial taxa result in significantly different communities on alternate Mastocarpus life history phases, rocky substrate and seawater at all intertidal elevations. For microeukaryote assemblages, only high intertidal samples had significant differences between life history phases although sporophytes were not different from the rocky substrate at this elevation; gametophytes and sporophytes did not differ in microeukaryote communities in the mid and low zones. By sequencing three host genes, we identified three cryptic species of Mastocarpus in our data set, which co-occur in the mid-to-low intertidal zone. In these samples, M. alaskensis sporophytes harboured distinct bacterial communities compared to M. agardhii and M. intermedius sporophytes, which were not distinguishable. Conversely, microeukaryote communities did not differ among species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».