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Enregistrement W2883184335 · doi:10.7554/elife.38337

Synergy between the small intrinsically disordered protein Hsp12 and trehalose sustain viability after severe desiccation

2018· article· en· W2883184335 sur OpenAlexfundno aff
Skylar Xantus Kim, Gamze Çamdere, Xuchen Hu, Douglas Koshland, Hugo Tapia

Notice bibliographique

RevueeLife · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueTardigrade Biology and Ecology
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthUniversity of TorontoG. Harold and Leila Y. Mathers Charitable FoundationDamon Runyon Cancer Research Foundation
Mots-clésDesiccationTrehaloseCryptobiosisDesiccation toleranceBudding yeastBiologyYeastCell biologyIn vitroComputational biologyBiochemistrySaccharomyces cerevisiaeBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Anhydrobiotes are rare microbes, plants and animals that tolerate severe water loss. Understanding the molecular basis for their desiccation tolerance may provide novel insights into stress biology and critical tools for engineering drought-tolerant crops. Using the anhydrobiote, budding yeast, we show that trehalose and Hsp12, a small intrinsically disordered protein (sIDP) of the hydrophilin family, synergize to mitigate completely the inviability caused by the lethal stresses of desiccation. We show that these two molecules help to stabilize the activity and prevent aggregation of model proteins both in vivo and in vitro. We also identify a novel in vitro role for Hsp12 as a membrane remodeler, a protective feature not shared by another yeast hydrophilin, suggesting that sIDPs have distinct biological functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,183 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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