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Enregistrement W2883210621 · doi:10.1038/s12276-018-0116-z

Spotlight on protein N-terminal acetylation

2018· review· en· W2883210621 sur OpenAlexaff
Rasmus Ree, Sylvia Varland, Thomas Arnesen

Notice bibliographique

RevueExperimental & Molecular Medicine · 2018
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePeptidase Inhibition and Analysis
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNorges ForskningsrådEuropean CommissionKreftforeningen
Mots-clésAcetylationAcetyltransferasesAcetyltransferaseAcetyl-CoAPosttranslational modificationTerminal (telecommunication)BiochemistryFolding (DSP implementation)ChemistryProtein foldingEnzymeBiologyCell biologyComputational biologyGeneComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

N-terminal acetylation (Nt-acetylation) is a widespread protein modification among eukaryotes and prokaryotes alike. By appending an acetyl group to the N-terminal amino group, the charge, hydrophobicity, and size of the N-terminus is altered in an irreversible manner. This alteration has implications for the lifespan, folding characteristics and binding properties of the acetylated protein. The enzymatic machinery responsible for Nt-acetylation has been largely described, but significant knowledge gaps remain. In this review, we provide an overview of eukaryotic N-terminal acetyltransferases (NATs) and the impact of Nt-acetylation. We also discuss other functions of known NATs and outline methods for studying Nt-acetylation. A chemical modification of protein structure called N-terminal acetylation occurs normally in many circumstances, but is also implicated in diseases including cancers and developmental disorders. It adds an acetyl group, composed of a carbonyl group (C = O) linked to a methyl group (CH3), to the nitrogen atom found at one end of a protein chain. Thomas Arnesen at the University of Bergen in Norway and colleagues review the understanding of this modification and survey the enzymes that carry it out. Acetylation occurs on around 80% of human proteins and affects crucial aspects of their function. These include the stability that determines proteins’ lifetimes inside cells, the three-dimensional structures that proteins fold into, and the interactions between different proteins. Advances in analytical techniques are yielding new insights into the role of N-terminal acetylation in health and disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,024

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,398
Écart entre enseignants0,355 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations651
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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