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Enregistrement W2883391579 · doi:10.1186/s13100-018-0129-0

Deletion of the sex-determining gene SXI1α enhances the spread of mitochondrial introns in Cryptococcus neoformans

2018· article· en· W2883391579 sur OpenAlexafffund
Zhun Yan, Zhimin Li, Yan Li, Yongting Yu, Yi Cheng, Jia Chen, Yunyun Liu, Chunsheng Gao, Liangbin Zeng, Xiangping Sun, Litao Guo, Jianping Xu

Notice bibliographique

RevueMobile DNA · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesAgricultural Science and Technology Innovation ProgramNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaChinese Academy of Agricultural Sciences
Mots-clésCryptococcus neoformansBiologyHuman geneticsIntronGeneGeneticsMitochondrial DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Homing endonuclease genes (HEGs) are widely distributed genetic elements in the mitochondrial genomes of a diversity of eukaryotes. Due to their ability to self-propagate within and between genomes, these elements can spread rapidly in populations. Whether and how such elements are controlled in genomes remains largely unknown. Here we report that the HEG-containing introns in the mitochondrial COX1 gene in Cryptococcus neoformans are mobile and that their spread in sexual crosses is influenced by mating type ( MAT ) α-specific homeodomain gene SXI1 α. C. neoformans has two mating types, MAT a and MAT α . In typical crosses between strains of the two mating types , only a small portion (< 7%) of diploid fusants inherited the HEGs from the MAT α parent. However, disruption of the SXI1 α gene resulted in the majority (> 95%) of the diploid fusants inheriting the HEG-containing introns from the MAT α parent, a frequency significantly higher than those of intronless mitochondrial genes. Our results suggest that SXI1 α not only determines uniparental mitochondrial inheritance but also inhibits the spread of HEG-containing introns in the mitochondrial genome in C. neoformans .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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