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Enregistrement W2883407846 · doi:10.1186/s13058-018-1012-0

The Prosigna gene expression assay and responsiveness to adjuvant cyclophosphamide-based chemotherapy in premenopausal high-risk patients with breast cancer

2018· article· en· W2883407846 sur OpenAlexaff
Maj‐Britt Jensen, Anne‐Vibeke Lænkholm, Torsten O. Nielsen, Jens Ole Eriksen, Pernille Wehn, Tressa Hood, Wesley Buckingham, Sean Ferree, Bent Ejlertsen

Notice bibliographique

RevueBreast Cancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBreast Cancer Treatment Studies
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSurgical oncologyCyclophosphamideMedicineBreast cancerOncologyAdjuvant chemotherapyInternal medicineChemotherapyAdjuvantCancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The PAM50-based (Prosigna) risk of recurrence (ROR) score and intrinsic subtypes are prognostic for women with high-risk breast cancer. We investigate the predictive ability of Prosigna regarding the effectiveness of cyclophosphamide-based adjuvant chemotherapy in premenopausal patients with high-risk breast cancer. Prosigna assays were performed on the NanoString platform in tumors from participants in Danish Breast Cancer Group (DBCG) 77B, a four-arm trial that randomized premenopausal women with high-risk early breast cancer to no systemic treatment, levamisole, oral cyclophosphamide (C) or cyclophosphamide, methotrexate and fluorouracil (CMF). In total, this retrospective analysis included 460 women (40% of the 1146 randomized patients). The continuous Prosigna ROR score was prognostic in the no systemic treatment group (unadjusted P < 0.001 for disease-free survival (DFS), P = 0.001 for overall survival (OS)). No statistically significant interaction of continuous ROR score and treatment on DFS and OS was found. A highly significant association was observed between intrinsic subtypes and C/CMF treatment for DFS ( P interaction = 0.003 unadjusted, P = 0.001 adjusted) and OS ( P interaction = 0.04). In the adjusted analysis treatment with C/CMF was associated with a reduced risk of DFS events in patients with basal-like (hazard ratio (HR) 0.14; 95% CI 0.06; 0.32) and luminal B (HR 0.48; 95% CI 0.27; 0.84) subtypes but not in patients with Human epidermal growth factor receptor-enriched (HR 1.05; 95% CI 0.56; 1.95) or luminal A (HR 0.61; 95% CI 0.32; 1.16) subtypes. The Prosigna ROR score and intrinsic subtypes were prognostic in high-risk premenopausal patients with breast cancer, and intrinsic subtypes identify high-risk patients with or without major benefit from adjuvant C/CMF treatment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil0,897

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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