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Enregistrement W2883490482 · doi:10.1017/cjn.2018.289

61 Functional characterization of ribosomal RNA methyltransferase NSUN5 in glioblastoma

2018· article· en· W2883490482 sur OpenAlexvenueno aff
Jiesi Zhou, Krista M. Vincent, Scott D. Findlay, Daniel Choi, Roseline Godbout, Lynne‐Marie Postovit, Yangxin Fu

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésU87Cancer researchBiologyReprogrammingGliomaRibosomal RNARNAMethyltransferaseGlioblastomaBrain tumorPhenotypeCancerMethylationCellPathologyGeneMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Glioblastoma is the most common and malignant brain tumor with a median overall survival of 20.5 months. There is an urgent need to develop novel therapeutic strategies. Using a glioblastoma TCGA dataset, we have determined that high NSUN5 mRNA expression is strongly associated with poor survival in glioblastoma patients. NSUN5 is a ribosomal RNA (rRNA) cytosine methyltransferase. Human NSUN5 is located in chromosome 7 and is completely deleted in the Williams-Beurren syndrome, a complex neurodevelopmental disorder. However, RNA targets of NSUN5 in mammals and its role in cancer are unknown. The objective of this project is to determine whether elevated NSUN5 changes rRNA methylation pattern and thereby leads to pro-tumorigenic translational reprogramming and pro-tumorigenic phenotypes in glioblastoma. Western blotting showed that NSUN5 is expressed in 7 out of 9 established glioblastoma cell lines and in 8 out of 12 primary patient-derived glioblastoma cell lines. Bisulfite sequencing confirmed that NSUN5 methylates C3782 of human 28S rRNA in glioblastoma cells. Functionally, overexpression of NSUN5 increases, whereas NSUN5 knockout decreases global protein synthesis and sphere formation in glioblastoma cells. More importantly, mice bearing intracranial NSUN5-expressing U87 tumors survived for a shorter time than mice bearing tumors derived from U87 control cells. Our results suggest that NSUN5 methylates 28S rRNA and may enhance cancer stem cell phenotypes and tumor formation and/or progression in glioblastoma. Experiments are ongoing to determine whether NSUN5 promotes tumor formation and/or progression through translational reprogramming in glioblastoma. This study may help identify novel therapeutic targets for glioblastoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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