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Enregistrement W2883553124 · doi:10.1186/s13071-018-3005-3

Identification and preliminary characterization of Hc-clec-160, a novel C-type lectin domain-containing gene of the strongylid nematode Haemonchus contortus

2018· article· en· W2883553124 sur OpenAlexfundno aff
Ling Zhang, Lingyun Mou, Xueqiu Chen, Yi Yang, Min Hu, Xiangrui Li, Xun Suo, Xing‐Quan Zhu, Aifang Du

Notice bibliographique

RevueParasites & Vectors · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueHelminth infection and control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Key Research and Development Program of ChinaInstitute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of SciencesChinese Academy of SciencesState Key Laboratory of Veterinary Etiological BiologyInstitute of GeneticsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésHaemonchus contortusBiologyCaenorhabditis elegansGene knockdownRNA interferenceNematodeGeneExonC-type lectinMolecular biologyParasitologyGeneticsRNALectinZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The strongylid parasite Haemonchus contortus causes severe anemia in domestic animals worldwide. Effective preventive and therapeutical agents are lacking, because of drug resistance and that little is known about the molecular mechanism of the interaction between H. contortus and host cells. METHODS: A new gene, Hc-clec-160, was discovered with RT-PCR. Transcriptional levels of Hc-clec-160 and Ce-clec-160 throughout different growth phases of corresponding nematodes were assayed by qPCR. Immunofluorescence staining of paraffin section were performed to determine the protein localization in adult worms of H. contortus. To monitor the promoter capacity of the 5'-flanking region of Ce-clec-160, micro-injection was used. Overexpression and RNAi constructs was carried out in the N2 strain of Caenorhabditis elegans to find out the gene function of Hc-clec-160. RESULTS: The full-length cDNA of 1224 bp of Hc-clec-160 was cloned by RT-PCR. The corresponding gene contained twelve exons. Its transcripts peaked in male adult worms. Hc-CLEC-160 was predicted to have a Willebrand factor type A (vWA) domain and a C-type lectin domain. The proteins were not detected by expression in C. elegans or paraffin section experiments in adult of H. contortus. Knockdown of Ce-clec-160 expression in C. elegans by RNAi resulted in shortened body length and decreased brood size. CONCLUSIONS: In this experiment, a new gene Hc-clec-160 was obtained in H. contortus and its function was addressed using a model organism: C. elegans. Our study showed that Hc-clec-160 possesses characteristics similar to those of Ce-clec-160 and plays an important role in the growth and reproduction of this parasitic nematode.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,699
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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