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Enregistrement W2883852692 · doi:10.3389/fmicb.2018.01573

The Identification of DepB: An Enzyme Responsible for the Final Detoxification Step in the Deoxynivalenol Epimerization Pathway in Devosia mutans 17-2-E-8

2018· article· en· W2883852692 sur OpenAlexafffund
Jason Carere, Yousef I. Hassan, Dion Lepp, Ting Zhou

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycotoxins in Agriculture and Food
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésEpimerEnzymeMetabolic pathwayBiotransformationDetoxification (alternative medicine)MycotoxinBiochemistryChemistryBacteriaBiologyMicrobiologyStereochemistryFood scienceGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Deoxynivalenol (DON) is one of the most common mycotoxins found in cereal grains and grains contaminated with DON can cause health issues for both humans and animals and result in severe economic losses. Currently there is no feasible method to remediate affected grains. The development of a biological method for detoxification is becoming increasingly more plausible with the discovery of microbes which can transform DON to a relatively non-toxic stereoisomer, 3-epi-DON. Although bacteria capable of detoxifying DON have been known for some time, it is only recently an enzyme responsible was identified. In Devosia mutans 17-2-E-8 (Devosia sp. 17-2-E-8) a two-step DON epimerization pathway, designated as the Dep system, completes this reaction. DepA was recently identified as the enzyme responsible for the conversion of DON to 3-keto-DON, and in this report, DepB, a NADPH dependent dehydrogenase, is identified as the second and final step in the pathway. DepB readily catalyses the reduction of 3-keto-DON to 3-epi-DON. DepB is shown to be moderately thermostable as it did not lose significant activity after a heat treatment at 55 °C and it is amenable to lyophilisation. DepB functions at a range of pH values (5-9) and functions equally well in multiple common buffers. DepB is clearly a NADPH dependent enzyme as it utilizes it much more efficiently than NADH. The discovery of the final step in the DON epimerization pathway may provide a means to finally mitigate the losses from DON contamination in cereal grains through an enzymatic detoxification system. The further development of this system will need to focus on the activity of the Dep enzymes under conditions mimicking industrially relevant conditions to test their functionality for use in areas such as corn milling, fuel ethanol fermentation or directly in animal feed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,597
Score d'incertitude au seuil0,484

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations80
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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