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Enregistrement W2883882405 · doi:10.1017/cjn.2018.305

09 Could DLX2 regulation of neural progenitor cell fate contribute to differentiation of diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG)?

2018· article· en· W2883882405 sur OpenAlexvenueno aff
Mikaela Nevin, Xiaohua Song, Sara Japoni, Jamie Zagozewski, Qiang Jiang, Oren J. Becher, Roseline Godbout, DA Underhill, David D. Eisenstat

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCircular RNAs in diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOLIG2BiologyChromatin immunoprecipitationHistone H3NeurosphereCancer researchTranscription factorGeneticsHistoneCellular differentiationPromoterOligodendrocyteGene expressionGeneMyelinNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Diffuse intrinsic pontine glioma (DIPG) is refractory to therapy. The identification of histone H3.1/H3.3 K27M mutations in most DIPG has provided new insights. The DLX homeobox genes are expressed in the developing forebrain. The Dlx1/Dlx2 double knockout (DKO) mouse loses tangential GABAergic interneuron migration to the neocortex. We have identified genes that encode glutamic acid decarboxylase (GAD) enzymes as direct targets of DLX1/DLX2. In DIPG patients with H3.3 K27M mutations there is decreased Dlx2 and increased expression of the myelin transcription factor, Myt1. Methods and Results: We used bioinformatics approaches and chromatin immunoprecipitation (ChIP) assays to identify Olig2, Nkx2.2 and Myt1 promoter sequences as candidate DLX2 targets in vivo. DNA binding specificity was confirmed. The functional consequences of Dlx2 co-expression with reporter constructs of ChIP-isolated promoter fragments of Olig2 and Nkx2.2 demonstrated repression of gene targets in vitro. qPCR showed increased Olig2 and Nkx2.2 expression in the DKO forebrain. Stable transfection of a murine DIPG cell line with Dlx2 resulted in increased Gad1 and Gad2 and decreased Olig2 and Nkx2.2 expression. Of significance, we demonstrated decreased expression of H3.3 K27M and restoration of H3.3 K27 tri-methylation (me3). Conclusions: DLX transcription factors promote GABAergic interneuron and concomitant inhibition of oligodendroglial differentiation in neural progenitors by repression of a suite of genes including Olig2 and Nkx2.2. Restoration of H3 K27me3 expression in DIPG provides a promising lead towards exploration of differentiation as a therapeutic strategy for DIPG.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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