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Enregistrement W2883931306 · doi:10.1080/20013078.2018.1490144

Molecular subtypes and differentiation programmes of glioma stem cells as determinants of extracellular vesicle profiles and endothelial cell‐stimulating activities

2018· article· en· W2883931306 sur OpenAlexafffund
Cristiana Spinelli, Laura Montermini, Brian Meehan, Alain Brisson, Sisareuth Tan, Dongsic Choi, Ichiro Nakano, Janusz Rak

Notice bibliographique

RevueJournal of Extracellular Vesicles · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueExtracellular vesicles in disease
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Cancer Society Research InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyStem cellGliomaCell biologyPhenotypeExtracellular vesicleCancer stem cellCellular differentiationContext (archaeology)TranscriptomeCancer researchEndothelial stem cellMesenchymal stem cellMicrovesiclesGeneGene expressionGeneticsIn vitromicroRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT We have previously uncovered the impact of oncogenic and differentiation processes on extracellular vesicles (EVs) in cancer. This is of interested in the context of glioma stem cells (GSC) that are responsible for recurrent nature of glioblastoma multiforme (GBM), while retaining the potential to undergo differentiation and self renewal. GSCs reside in vascular niches where they interact with endothelial cells through a number of mediators including bioactive cargo of EVs. GSCs can be classified as proneural (PN) or mesenchymal (MES) subtypes on the basis of their gene expression profiles and distinct biological characteristics. In the present study we investigated how GSC diversity and differentiation programmes influence their EV‐mediated communication potentials. Indeed, molecular subtypes of GBMs and GSCs differ with respect to their expression of EV‐related genes (vesiculome) and GSCs with PN or MES phenotypes produce EVs with markedly different characteristics, marker profiles, proteomes and endothelial stimulating activities. For example, while EVs of PN GSC are largely devoid of exosomal markers their counterparts from MES GSCs express ample CD9, CD63 and CD81 tetraspanins. In both GSC subtypes serum‐induced differentiation results in profound, but distinct changes of cellular phenotypes including the enhanced EV production, reconfiguration of their proteomes and the related functional pathways. Notably, the EV uptake was a function of both subtype and differentiation state of donor cells. Thus, while, EVs produced by differentiated MES GSCs were internalized less efficiently than those from undifferentiated cells they exhibited an increased stimulatory potential for human brain endothelial cells. Such stimulating activity was also observed for EVs derived from differentiated PN GSCs, despite their even weaker uptake by endothelial cells. These findings suggest that the role of EVs as biological mediators and biomarkers in GBM may depend on the molecular subtype and functional state of donor cancer cells, including cancer stem cells. Abbreviations: CryoTEM: cryo‐transmission electron microscopy; DIFF: differentiated GSCs; EGF: epidermal growth factor; DUC: differential ultracentrifugation; EV: extracellular vesicle; FGF: fibroblast growth factor; GBM: glioblastoma multiforme; GFAP: glial fibrillary acidic protein; GO: gene ontology; GSC: glioma stem cells; HBEC‐5i: human brain endothelial cells; MES: mesenchymal cells; MTS ‐ [3‐(4,5‐dimethylthiazol‐2‐yl)‐5‐(3‐carboxymethoxyphenyl)‐2‐(4‐sulfophenyl)‐2H‐tetrazolium, inner salt; PMT1: proneural‐to‐mesenchyman transition cell line 1; PN: proneural cells; TEM: transmission electron microscopy; WB: western blotting

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations68
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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