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Enregistrement W2884010595 · doi:10.1159/000490252

Gene Expression Profiling as an Adjunctive Measure to Guide the Management of Indeterminate, High-Risk Choroidal Melanocytic Lesions: A Pilot Study

2018· article· en· W2884010595 sur OpenAlexaff
Ezekiel Weis, Kelsey A. Roelofs, Matthew Larocque, Albert Murtha

Notice bibliographique

RevueOcular Oncology and Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOcular Oncology and Treatments
Établissements canadiensUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineIndeterminateBiopsyProspective cohort studyCohortPathologyInternal medicineSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Purpose: To describe our early experience with gene expression profiling (GEP) assessment for juxtafoveal, subfoveal, and peripapillary indeterminate high-risk melanocytic lesions to assist in making early treatment decisions in patients who did not feel comfortable with either close observation or definitive treatment. Methods: A prospective cohort of patients with indeterminate lesions who underwent GEP were enrolled. Nonparametric statistical analysis was utilized given the small sample size. Results: Fifteen patients were included in this series. Six (40%) were class 1A and 9 (60%) class 1B. Class 1A and 1B lesions had a median of three and four clinical risk factors, respectively (p = 0.27). There was no statistically significant difference for the largest basal diameter between the classes (p = 0.31); however, class 1B lesions were thicker than class 1A lesions (p = 0.03). None of the class 1A lesions showed definite growth or metastasis over a mean follow-up period of 17.1 ± 1.8 months from fine needle aspiration biopsy. All class 1B patients opted for plaque brachytherapy, and to date none of these patients have developed metastasis, with a mean follow-up of 18.7 ± 8.4 months. Conclusion: There may be a role for GEP assessment in high-risk, indeterminate, posteriorly located choroidal lesions to assist in treatment planning.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,337
Écart entre enseignants0,306 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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