Methicillin-resistant<i>Staphylococcus aureus</i>colonisation: epidemiological and molecular characteristics in an acute-care tertiary hospital in Singapore
Notice bibliographique
Résumé
Current knowledge of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) colonisation in relation to epidemiological characteristics is incomplete. We conducted a cross-sectional study at an acute-care tertiary infectious diseases hospital of MRSA isolates identified through routine surveillance from January 2009 to December 2011. We randomly selected 205 MRSA isolates (119 inpatients) from 798 isolates (427 inpatients) for molecular profiling using multilocus sequence typing. Multilevel multinomial logistic regression was used to estimate odds ratio (OR) assessing the predilection of MRSA strains for anatomic sites, and associations of strains with human immunodeficiency virus (HIV) infection. The most frequent sequence types (STs) were 239, 22 and 45. The proportion of ST22 increased over the sampling period, replacing ST239 as the dominant lineage. However, ST239 remained the most prevalent among HIV-seropositive individuals who were six times more likely to be colonised with this strain than non-HIV patients (adjusted OR (aOR) 6.44, 95% confidence interval (CI) 1.94-21.36). ST45 was >24 times more likely to be associated with perianal colonisation than in the nares, axillae and groin sites (aOR 24.20, 95% CI 1.45-403.26). This study underlines the clonal replacement of MRSA in Singapore as previously reported but revealed, in addition, key strain differences between HIV-infected and non-infected individuals hospitalised in the same environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».