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Enregistrement W2884298210 · doi:10.1016/j.ajhg.2018.07.001

Mutations in TOP3A Cause a Bloom Syndrome-like Disorder

2018· article· en· W2884298210 sur OpenAlexafffund
Carol-Anne Martin, Kata Sarlós, Clare V. Logan, Roshan Singh Thakur, David Parry, Anna H. Bizard, Andrea Leitch, Louise Cleal, Nadia Shaukat Ali, Mohammed Al‐Owain, William Allen, Janine Altmüller, Miriam Aza‐Carmona, Bushra A.Y. Barakat, Jimena Barraza‐García, Amber Begtrup, Massimo Bogliolo, Megan T. Cho, Jaime Cruz‐Rojo, Hassan Ali Mundi Dhahrabi, Nursel Elçioğlu, Gráinne S. Gorman, Rebekah Jobling, Ian Kesterton, Yoshihito Kishita, Masakazu Kohda, Polona Le Quesne Stabej, Asam Jassim Malallah, Peter Nürnberg, Akira Ohtake, Yasushi Okazaki, Roser Pujol, Marı́a José Ramı́rez, Anya Revah‐Politi, Masaru Shimura, Paul E. Stevens, Robert W. Taylor, Lesley Turner, Hywel Williams, Carolyn M. Wilson, Gökhan Yigit, Laura Zahavich, Fowzan S. Alkuraya, Jordi Surrallés, Alejandro Iglesias, Kei Murayama, Bernd Wollnik, Mehul Dattani, Karen E. Heath, Ian D. Hickson, Andrew P. Jackson

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIInstitute of GeneticsNational Institutes of HealthMedical Research Council CanadaInstitució Catalana de Recerca i Estudis AvançatsNIHR Great Ormond Street Hospital Biomedical Research CentreMinisterio de Economía y CompetitividadNational Institute for Health and Care ResearchGreat Ormond Street Hospital CharityBundesministerium für Bildung und ForschungDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Research FoundationMedical Research CouncilDanmarks GrundforskningsfondEuropean Research CouncilE-RareNational Center for Advancing Translational SciencesWellcome TrustEuropean Regional Development FundEuropean CommissionJapan Agency for Medical Research and DevelopmentKræftens Bekæmpelse
Mots-clésBloomBloom syndromeGeneticsMedicineBiologyGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bloom syndrome, caused by biallelic mutations in BLM, is characterized by prenatal-onset growth deficiency, short stature, an erythematous photosensitive malar rash, and increased cancer predisposition. Diagnostically, a hallmark feature is the presence of increased sister chromatid exchanges (SCEs) on cytogenetic testing. Here, we describe biallelic mutations in TOP3A in ten individuals with prenatal-onset growth restriction and microcephaly. TOP3A encodes topoisomerase III alpha (TopIIIα), which binds to BLM as part of the BTRR complex, and promotes dissolution of double Holliday junctions arising during homologous recombination. We also identify a homozygous truncating variant in RMI1, which encodes another component of the BTRR complex, in two individuals with microcephalic dwarfism. The TOP3A mutations substantially reduce cellular levels of TopIIIα, and consequently subjects' cells demonstrate elevated rates of SCE. Unresolved DNA recombination and/or replication intermediates persist into mitosis, leading to chromosome segregation defects and genome instability that most likely explain the growth restriction seen in these subjects and in Bloom syndrome. Clinical features of mitochondrial dysfunction are evident in several individuals with biallelic TOP3A mutations, consistent with the recently reported additional function of TopIIIα in mitochondrial DNA decatenation. In summary, our findings establish TOP3A mutations as an additional cause of prenatal-onset short stature with increased cytogenetic SCEs and implicate the decatenation activity of the BTRR complex in their pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations99
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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