Viral Loads Within 6 Weeks After Diagnosis of HIV Infection in Early and Later Stages: Observational Study Using National Surveillance Data
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Early (including acute) HIV infection is associated with viral loads higher than those in later stages. OBJECTIVE: This study aimed to examine the association between acute infection and viral loads near the time of diagnosis using data reported to the US National HIV Surveillance System. METHODS: We analyzed data on infections diagnosed in 2012-2016 and reported through December 2017. Diagnosis and staging were based on the 2014 US surveillance case definition for HIV infection. We divided early HIV-1 infection (stage 0) into two subcategories. Subcategory 0α: a negative or indeterminate HIV-1 antibody test was ≤60 days after the first confirmed positive HIV-1 test or a negative or indeterminate antibody test or qualitative HIV-1 nucleic acid test (NAT) was ≤180 days before the first positive test, the latter being a NAT or detectable viral load. Subcategory 0β: a negative or indeterminate antibody or qualitative NAT was ≤180 days before the first positive test, the latter being an HIV antibody or antigen/antibody test. We compared median earliest viral loads for each stage and subcategory in each of the first 6 weeks after diagnosis using only the earliest viral load for each individual. RESULTS: Of 203,392 infections, 56.69% (115,297/203,392) were reported with a quantified earliest viral load within 6 weeks after diagnosis and criteria sufficient to determine the stage at diagnosis. Among 5081 infections at stage 0, the median earliest viral load fell from 694,000 copies/mL in week 1 to 125,022 in week 2 and 43,473 by week 6. Among 30,910 infections in stage 1, the median earliest viral load ranged 15,412-17,495. Among 42,784 infections in stage 2, the median viral load declined from 44,973 in week 1 to 38,497 in week 6. Among 36,522 infections in stage 3 (AIDS), the median viral load dropped from 205,862 in week 1 to 119,000 in week 6. The median earliest viral load in stage 0 subcategory 0α fell from 1,344,590 copies/mL in week 1 to 362,467 in week 2 and 47,320 in week 6, while that in subcategory 0β was 70,114 copies/mL in week 1 and then 32,033 to 44,067 in weeks 2-6. The median viral load in subcategory 0α was higher than that in subcategory 0β in each of the first 6 weeks after diagnosis (P<.001). CONCLUSIONS: In the 1st week after diagnosis, viral loads in early infections are generally several times higher than those in later stages at diagnosis. By the 3rd week, however, most are lower than those in stage 3. High viral loads in early infection are much more common in subcategory 0α than in subcategory 0β, consistent with 0α comprising mostly acute infections and 0β comprising mostly postacute early infections. These findings may inform the prioritization of interventions for prevention.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,007 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».