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Enregistrement W2884474817 · doi:10.25224/1097-993x-19.1.6

Molecular Phylogeny of <i>Pectis</i> (Tageteae, Asteraceae), a C <sub>4</sub> Genus of the Neotropics, and its Sister Genus <i>Porophyllum</i>

2016· article· en· W2884474817 sur OpenAlexaff
Debra R. Hansen, Robert K. Jansen, Rowan F. Sage, José Luís Villaseñor, Beryl B. Simpson

Notice bibliographique

RevueLundellia · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Diversity and Evolution
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesArizona State University
Mots-clésMonophylyBiologyGenusCladeSister groupMolecular phylogeneticsBotanyPhylogeneticsZoologyEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pectis is a genus of ±90 xeric adapted New World species. Previous molecular phylogenetic studies showed Pectis closely related to Porophyllum, and one analysis resolved Porophyllum species nested within Pectis. Some Pectis species are known to use C4 photosynthesis. Here we investigate the phylogeny of Pectis and Porophyllum, examine the ploidy levels and geographical distribution of Pectis species in light of its phylogeny, and infer the origin and extent of C4 photosynthesis in both genera. Chloroplast and ITS data from 78 Pectis and 22 Porophyllum species were used to test the monophyly of Pectis and its previously described sections. Carbon isotope data were obtained to infer the photosynthetic pathway of 80 species, and the results mapped on the inferred phylogenies to determine the timing and pattern of evolution of the C4 pathway. The ITS dataset supports a monophyletic Pectis sister to a monophyletic Porophyllum, while the chloroplast dataset places two Porophyllum species sister to a combined Pectis Porophyllum clade. Five well-supported lineages are recovered in Pectis. All Pectis sampled have ∂13C values consistent with C4 photosynthesis, and all Porophyllum species sampled have ∂13C values consistent with C3 photosynthesis. We conclude that Pectis is monophyletic but only two of its recognized sections are monophyletic. Porophyllum is monophyletic but its sections are not. Porophyllum amplexicaule and Pr. scoparium should be treated as members of a new genus. The switch to the C4 pathway in Pectis happened in the late Miocene, probably in north/central Mexico, at or after the divergence of Pectis and Porophyllum. This location and timing is consistent with the evolution of C4 photosynthesis in other North American eudicot lineages, suggesting similar environmental conditions may underlie the switch to C4 photosynthesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,141
Score d'incertitude au seuil0,162

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,163
Écart entre enseignants0,154 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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