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Enregistrement W2884484739 · doi:10.1080/15548627.2018.1480849

Oh, SNAP! How enteroviruses redirect autophagic traffic away from degradation

2018· letter· en· W2884484739 sur OpenAlexafffund
Abigail K. Corona, Yasir Mohamud, William T. Jackson, Honglin Luo

Notice bibliographique

RevueAutophagy · 2018
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Immunology Research
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésPicornavirusBiologyAutophagyCell biologyViral replicationVirologyVirusPicornaviridaeCellRNA virusCytosolRNAPoliovirusGeneticsBiochemistryApoptosisGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Picornaviruses, one of the major causes of human diseases ranging from the common cold to acute flaccid paralysis, have a short cytosolic lifecycle that, in cultured cells, ends in cell lysis. For years, the prevailing model was that these viruses exit from cells exclusively through cell lysis. However, over the last several years it has become apparent that for some picornaviruses, a macroautophagy/autophagy-related pathway can result in release of virus particles wrapped in a membrane containing autophagic markers. It has been proposed that this enveloped release predominates within hosts, allowing cell-to-cell movement of virus while minimizing exposure to the immune system. One reason that picornaviruses induce the autophagy pathway is to provide membrane scaffolds for RNA replication complexes. Perhaps more importantly, acidified autophagosomes (known as amphisomes) provide havens for maturation of new viral particles into infectious viruses. In back-to-back papers recently published in Cell Reports, our labs investigated a basic question: if picornavirus particles are maturing inside amphisomes, then how are they avoiding the typical degradative fate of autophagic cargo and exiting the cell intact?

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,007
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,007
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0080,012
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0080,008

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,299
Écart entre enseignants0,255 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2018
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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