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Enregistrement W2884622219 · doi:10.1039/c7np00064b

The value of universally available raw NMR data for transparency, reproducibility, and integrity in natural product research

2018· review· en· W2884622219 sur OpenAlex
James B. McAlpine, Shao‐Nong Chen, Andrei G. Kutateladze, John B. MacMillan, Giovanni Appendino, Andersson Barison, Mehdi A. Beniddir, Maique W. Biavatti, Stefan Blüml, Asmaa Boufridi, Mark S. Butler, Robert J. Capon, Young Hae Choi, David Coppage, Phillip Crews, Michael T. Crimmins, Marie Csete, Pradeep Dewapriya, Joseph M. Egan, Mary J. Garson, Grégory Genta‐Jouve, William H. Gerwick, Harald Gross, Mary Kay Harper, Precilia Hermanto, James M. Hook, Luke Hunter, Damien Jeannerat, Nai‐Yun Ji, Tyler A. Johnson, David G. I. Kingston, Hiroyuki Koshino, Hsiau‐Wei Lee, Guy Lewin, Jie Li, Roger G. Linington, Miaomiao Liu, Kerry L. McPhail, Tadeusz F. Molinski, Bradley S. Moore, Joo‐Won Nam, Ram P. Neupane, Matthias Niemitz, Jean‐Marc Nuzillard, Nicholas H. Oberlies, Fernanda Maria Marins Ocampos, Guohui Pan, Ronald J. Quinn, D. Sai Reddy, Jean‐Hugues Renault, José Rivera‐Chávez, Wolfgang Robien, Carla M. Saunders, Thomas J. Schmidt, Christoph Seger, Ben Shen, Christoph Steinbeck, Hermann Stuppner, Sonja Sturm, Orazio Taglialatela‐Scafati, Dean J. Tantillo, Robert Verpoorte, Bin‐Gui Wang, Craig M. Williams, Philip G. Williams, Julien Wist, Jian‐Min Yue, Chen Zhang, Zhengren Xu, Charlotte Simmler, David C. Lankin, Jonathan Bisson, Guido F. Pauli

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueNatural Product Reports · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolomics and Mass Spectrometry Studies
Établissements canadiensBurnaby HospitalSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésTransparency (behavior)ReproducibilityRaw dataResearch integrityNatural productBiochemical engineeringComputer scienceChemistryChromatographyEngineering ethicsEngineeringStereochemistryComputer security

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Covering: up to 2018With contributions from the global natural product (NP) research community, and continuing the Raw Data Initiative, this review collects a comprehensive demonstration of the immense scientific value of disseminating raw nuclear magnetic resonance (NMR) data, independently of, and in parallel with, classical publishing outlets. A comprehensive compilation of historic to present-day cases as well as contemporary and future applications show that addressing the urgent need for a repository of publicly accessible raw NMR data has the potential to transform natural products (NPs) and associated fields of chemical and biomedical research. The call for advancing open sharing mechanisms for raw data is intended to enhance the transparency of experimental protocols, augment the reproducibility of reported outcomes, including biological studies, become a regular component of responsible research, and thereby enrich the integrity of NP research and related fields.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,015
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,792
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0150,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,409
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle