38 Untangling the NFI-Calpain signaling axis in malignant glioma
Notice bibliographique
Résumé
Malignant gliomas (MG) are highly infiltrative tumours with a poor prognosis. Nuclear factor I (NFI) is a family of 4 transcription factors (NFIA, B, C and X) implicated in the regulation of genes involved in MG cell migration and infiltration, particularly the neural stem cell marker, brain fatty acid binding protein (B-FABP). NFI activity is regulated by its phosphorylation status, with hypophosphorylated NFI being the active form. Our results indicate that the phosphatase calcineurin is able to dephosphorylate NFI. In turn, calcineurin is cleaved and activated by calpain proteases. We have identified CAST, a gene that encodes calpain inhibitor, calpastatin, as a putative target of NFI based on chromatin immunoprecipitation. Putative NFI binding elements are located in intron 3 of the CAST gene. To determine whether there is a bona fide alternative promoter within intron 3 of CAST, we carried out gel shifts as well as luciferase reporter gene assays using both the canonical and alternative promoters of CAST. These assays confirmed CAST alternative promoter usage in MG cells. Knockdown of individual NFIs revealed a role for NFIC and NFIX in the repression of CAST gene expression, specifically in cells expressing the hypophosphorylated (active) form of NFI. NFI depletion also altered the subcellular localization of both calpain and calineurin protein. Our results suggest a feedback loop for the NFI –calcineurin – calpain – calpastatin pathway in MG cells which may regulate cell migration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».