MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2884801482 · doi:10.3389/fgene.2018.00260

CRISPR/Cas9 Application for Gene Copy Fate Survey of Polyploid Vertebrates

2018· review· en· W2884801482 sur OpenAlexaff
Fanqian Yin, Wenfu Liu, Jing Chai, Bin Lu, Robert W. Murphy, Jing Luo

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2018
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensRoyal Ontario Museum
Organismes subventionnairesNational Postdoctoral Program for Innovative TalentsYunnan Provincial Science and Technology DepartmentChina Postdoctoral Science FoundationNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésCRISPRPolyploidBiologyGeneticsCas9GeneEpigeneticsEvolutionary biologyGenomeComputational biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Polyploidization occurs widely in eukaryotes, and especially in plants. Polyploid plants and some fishes have been commercialized. Typically, severe genomic perturbations immediately follows polyploidization and little is known about how polyploid offspring survive the genetic and epigenetic changes. Investigations into this require the identification of genes related to polyploidization and the discrimination of dosage-balance from paternal and maternal copies, and regardless of the mechanism being either autopolyploidization or allopolyploidization. New approaches and technologies may discern the mosaic of novel gene functions gained through the recombination of paternal and maternal genes in allopolyploidization. Modifications of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) with CRISPR-associated system (Cas) protein 9 (CRISPR/Cas9) have been employed in studies of polyploidization of plants. However, the approach has seldom been applied to polyploidization in vertebrates. Herein, we use CRISPR/Cas9 to trace gene-fate in tetraploid goldfish, and specifically to identify the functional differentiation of two divergent copies of fgf20a, which are expressed differently throughout embryonic development. We expect this gene editing system will be applicable to studies of polyploids and the genetic improvement of polyploid livestock.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,910
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,356
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFrontiers in GeneticsMême sujetCRISPR and Genetic EngineeringTravaux en français237 207