CRISPR/Cas9 Application for Gene Copy Fate Survey of Polyploid Vertebrates
Notice bibliographique
Résumé
Polyploidization occurs widely in eukaryotes, and especially in plants. Polyploid plants and some fishes have been commercialized. Typically, severe genomic perturbations immediately follows polyploidization and little is known about how polyploid offspring survive the genetic and epigenetic changes. Investigations into this require the identification of genes related to polyploidization and the discrimination of dosage-balance from paternal and maternal copies, and regardless of the mechanism being either autopolyploidization or allopolyploidization. New approaches and technologies may discern the mosaic of novel gene functions gained through the recombination of paternal and maternal genes in allopolyploidization. Modifications of Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats (CRISPR) with CRISPR-associated system (Cas) protein 9 (CRISPR/Cas9) have been employed in studies of polyploidization of plants. However, the approach has seldom been applied to polyploidization in vertebrates. Herein, we use CRISPR/Cas9 to trace gene-fate in tetraploid goldfish, and specifically to identify the functional differentiation of two divergent copies of fgf20a, which are expressed differently throughout embryonic development. We expect this gene editing system will be applicable to studies of polyploids and the genetic improvement of polyploid livestock.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».