The murine female intestinal microbiota does not shift throughout the estrous cycle
Notice bibliographique
Résumé
Pregnancy is accompanied by maternal physiological adaptations including metabolic, endocrine, immune, cardiovascular, skeletomuscular and neurological modifications that facilitate fetal and placental growth and development. Emerging evidence suggests that the maternal intestinal microbiota is modified over the course of healthy pregnancy. We have recently identified a maternal intestinal microbial shift within hours of conception; a shift that continued with advancing gestation. It is possible that maternal gut bacterial profiles might be associated with the known endocrine changes that accompany the female reproductive (estrous) cycle. METHODS: To determine whether the estrous cycle influenced the shifts in the maternal intestinal microbiota, time-matched fecal pellets were collected daily for 3 consecutive estrous cycles from individually housed, non-pregnant female C57BL/6J mice (n = 10) fed a control diet. Estrous stage was identified by cell type predominance in vaginal cytological samples. The corresponding fecal pellets for each estrous stage were processed for bacterial 16S rRNA sequencing of the variable 3 (V3) region. RESULTS: Estrous cycle stage accounted for a very small and not statistically significant proportion of the variation in the fecal microbiota according to PERMANOVA testing performed on Bray-Curtis dissimilarity scores. These values displayed no significant clustering of fecal microbial communities by estrous stage. CONCLUSION: The estrous cycle does not result in any significant shift in the intestinal microbial community in the reproductively mature, regularly cycling female mouse.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».