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Enregistrement W2884863950 · doi:10.1186/s12881-018-0641-6

Association study between a polymorphic poly-T repeat sequence in the promoter of the somatostatin gene and metabolic syndrome

2018· article· en· W2884863950 sur OpenAlexafffundabout
Monique Tremblay, Diane Brisson, Daniel Gaudet

Notice bibliographique

RevueBMC Medical Genetics · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueNeuroendocrine Tumor Research Advances
Établissements canadiensUniversité du Québec à ChicoutimiUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMetabolic syndromeBiologyOdds ratioDyslipidemiaGeneticsInternal medicineEndocrinologyPromoterGenetic associationGeneDiabetes mellitusGene expressionSingle-nucleotide polymorphismGenotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Metabolic syndrome is a cluster of factors associated with an increased risk of developing type 2 diabetes mellitus (T2D) and coronary artery disease (CAD). It is a complex disorder resulting from the interaction between various environmental factors and genetic susceptibility. The somatostatin (SST) gene has been shown to regulate a wide range of functions, particularly in energy homeostasis. In addition, low levels of SST have been reported to have effects on the progression of metabolic syndrome components. The aim of this study was therefore to evaluate the association between polymorphic T sequences in the promoter of the SST gene and metabolic syndrome expression. METHODS: We studied 1725 French-Canadian subjects from a founder population selected on the basis of having a positive family history of dyslipidemia, CAD or T2D. The analysis were performed on four groups created according to the poly T polymorphism length in the 5' flanking promoter region of SST. Anova, Ancova and logistic regression models and Chi 2 analyses were used to evaluate the association between the poly T polymorphisms and metabolic syndrome components expression. RESULTS: Analyses showed that means, frequencies and odds ratio of metabolic syndrome components expression increase as the number of poly-T repeats in the promoter region of SST increases. Women exhibit more significant differences than men. However, the trends are the same in both genders and differences for most of the components are significant in the entire sample. CONCLUSION: Those results suggest that the poly T polymorphisms in the SST promoter region may influence several metabolic processes implicated in metabolic syndrome expression. More analyses are needed to document the mechanisms that could underlie genetic regulation effect of SST on metabolic syndrome components and to clarify its specific role.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,368

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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