Increasing Rates of Invasive Group A Streptococcal Disease in Alberta, Canada; 2003–2017
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background We present an analysis of increasing rates of invasive group A streptococci (iGAS) over a 15-year period in Alberta, Canada. Methods From 2003 to 2017, the emm type of iGAS isolates was identified from patients with iGAS disease in Alberta. Demographic, clinical, and risk factor data were collected. Results A total of 3551 cases of iGAS were identified in Alberta by isolation of a GAS isolate from a sterile site. The age-standardized incidence rates of iGAS increased from 4.24/100 000 in 2003 to 10.24 in 2017. Rates (SD) were highest in those age <1 (9.69) years and 60+ (11.15) years; 57.79% of the cases were male. Commonly identified risk factors included diabetes, hepatitis C, nonsurgical wounds, addiction, alcohol abuse, drug use, and homelessness. The overall age-standardized case fatality rate was 5.11%. The most common clinical presentation was septicemia/bacteremia (41.84%), followed by cellulitis (17.25%). The top 4 emm types from 2003–2017 were emm1, 28, 59, and 12. In 2017, the top 4 emm types (emm1, 74, 101, and 59) accounted for 46.60% of cases. Conclusions The incidence of iGAS disease in Alberta, Canada, has increased from 2003 to 2017. This increase has been driven not by a single emm type, but rather what has been observed is a collection of common and emerging emm types associated with disease. In addition, it is also likely that societal factors are playing important roles in this increase as risk factors associated with marginalized populations (addiction, alcohol abuse, and drug use) were found to have increased during the survey period.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».