A comparison of the Allplex™ bacterial and viral assays to conventional methods for detection of gastroenteritis agents
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: Molecular methods to detect diarrheal pathogens are increasingly being used in place of conventional methods. We compared a new multiplex real-time PCR assay for detection of both bacterial and viral gastroenteritis agents, the Allplex™ Gastrointestinal Panel Assays (AGPA), to conventional methods (stool culture for bacterial pathogens and electron microscopy (EM) for viral pathogens). RESULTS: Gastrointestinal viruses, in particular norovirus genogroup II viruses, were detected by the AGPA in a high number of specimens that were negative by EM. For bacterial pathogens, the AGPA was able to detect the organisms grown in culture with high sensitivity and additionally detected several types of E. coli, such as enteropathogenic E. coli (EPEC), enteroaggregative E. coli (EAEC), and non-O157 Shiga toxin-producing E. coli (STEC), that could not be detected with conventional culture methods. Overall, the AGPA had a > 2-fold higher detection rate than the conventional methods, with 24/135 (17.8%) samples positive by conventional methods and 60/135 (44.4%) by AGPA. Thus, diarrhea pathogen detection rates increased substantially with the use of the AGPA as compared to conventional methods.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle