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Enregistrement W2884943713 · doi:10.1017/cjn.2018.288

60 Are gangliogliomas in children and adults disorders of nervous system development?

2018· article· en· W2884943713 sur OpenAlexvenueno aff
Qiang Jiang, Jamie Zagozewski, Paolo Nozza, Beverly Wilson, Frank K.H. van Landeghem, David D. Eisenstat

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Neurological Sciences / Journal Canadien des Sciences Neurologiques · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOLIG2SynaptophysinBiologyPopulationCancer researchPathologyImmunohistochemistryOligodendrocyteCentral nervous systemMedicineNeuroscienceImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: Gangliogliomas (GGs) are neuroepithelial tumours of the central nervous system (CNS) composed of mature ganglion cells or a mixed population of ganglion and glial cells. Microarray data of low grade gliomas (LGG) including GGs revealed overexpression of the Dlx2 gene, a homeobox gene essential for interneuron migration and differentiation. We hypothesized that GGs are arrested in development, and began to explore the role of the Dlx2 gene. BRAF rearrangements and BRAF V600E point mutations have been reported in pediatric LGG. METHODS: DLX2 expression was examined in GGs using immunofluorescence (IF) and immunohistochemistry (IHC) labelling of formalin fixed paraffin embedded (FFPE) tissue sections, along with staining of glial and neuronal markers. BRAF mutations were detected using a commercial antibody and/or sequence verification of the DNA extracted from the FFPE blocks. RESULTS: In the Discovery cohort 10/30 were DLX2+ (33.3%) and in the Validation cohort 15/40 were DLX2+ (37.5%). Of these 15 cases, 15 were GFAP+ (100%), 15 were synaptophysin and/or NeuN+ (100%), and 13 were OLIG2+ (86.7%); 6 had a BRAF V600E mutation (40.0%). For the Validation cohort of 40 GGs, 28 were OLIG2+ (70.0%); 13/28 co-expressed DLX2 (46.4%). 18/40 cases had a BRAF V600 mutation(17 V600E, 1 V600G; 45.0%) and 6/18 were DLX2+ (33.3%). CONCLUSIONS: DLX2 is expressed in GGs in both neuronal and glial marker expressing tumour cells. Our results support that GGs arise from CNS progenitors arrested at the neuronal-glial cell fate “decision” point.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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