Genetic sequence variant (GSV) in <i>TERT-CLPTM1L </i>(5p15.33 locus) and survival in platinum-treated stage-IV non-small cell lung cancer (NSCLC).
Notice bibliographique
Résumé
1535 Background: Lung cancer is a leading cause of cancer-related mortality in North America. Besides tobacco smoking, inherited genetic factors can also influence the development of lung cancer. These genetic factors may lead to biologically distinct subsets of cancers that have different outcomes. We evaluated whether GSVs associated with lung cancer risk are also associated with overall survival (OS) and progress free survival (PFS) in platinum-treated stage-IV NSCLC patients. We chose this subset of patients with lung cancer because they are uniformly treated and followed up at our institute (Princess Margaret Hospital). Methods: A total of 32 candidate GSVs in 21 genes previously reported to be associated with lung cancer risk were genotyped in 188 platinum-treated NSCLC stage-IV patients. Illumina Custom GoldenGate Genotyping Panel was used for the genotyping assay platform. Multivariate Cox proportional hazard models adjusted for the potential clinical prognostic factors were generated for OS and PFS. Results: Median age is 60 yr (range: 31-81); 73% with adenocarcinoma. Median follow-up time is 27 mo; median OS is 16 mo and PFS is 8 mo. The top significant GSV was rs4975616 (g.1315660G>A) in telomerase reverse transcriptase (TERT) and cleft lip and palate transmembrane 1-like (CLPTM1L) gene on chromosome 5p15.33. The adjusted hazard ratio (aHR) for OS was 0.76 (95% CI: 0.58-0.99; p=0.04) and for PFS aHR was 0.70 (95% CI: 0.55-0.90; p=0.005) for each protective allele, respectively. This GSV has previously been associated with lung cancer risk in genome-wide association study (PMID: 19654303). Conclusions: The TERT-CLPTM1L:rs4975616 GSV is not only a risk factor for lung cancer but also is associated with survival in patients with stage-IV NSCLC treated with platinum based chemotherapy. GSVs may be able to define subsets of patients with different risk and prognosis of NSCLC. Future studies should evaluate whether this GSV is predictive or prognostic.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».