MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2884985934 · doi:10.1002/path.5136

Distinct developmental trajectories of endometriotic epithelium and stroma: implications for the origins of endometriosis

2018· letter· en· W2884985934 sur OpenAlexaff
Vivian Lac, David G. Huntsman

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2018
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEndometriosis Research and Treatment
Établissements canadiensVancouver General HospitalCanadian Centre for Applied Research in Cancer ControlUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndometriosisStromaStromal cellEpitheliumPathogenesisBiologyPathologySomatic cellPathologicalGermline mutationMutationCancer researchMedicineGeneticsGeneImmunohistochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Endometriosis is a common gynecological disease characterized by the ectopic growth of endometrium-like tissue. Despite the widespread prevalence of endometriosis, its pathogenesis remains poorly understood. A recent study by Noë et al provides evidence that the epithelium and stroma within the same endometriotic lesions follow distinct and independent developmental trajectories. They used droplet digital polymerase chain reaction analysis of laser-captured epithelium-enriched and stroma-enriched endometriosis tissue, and found that all 19 somatic passenger mutations analyzed were enriched exclusively in the epithelial compartment. These findings are consistent with the clonal expansion of epithelial cells, whereas stromal cells may be continuously regenerated or recruited over the course of disease. Further findings of differing allelic frequencies among passenger mutations within the epithelium of the same endometriotic lesions are suggestive of subclonality or the existence of multiple clones in some cases. Overall, the authors' observations of clonally dominant somatic passenger mutations in the epithelium and not the stroma of endometriosis add to the recent description of cancer-associated mutations in such lesions, and provide clues to the pathogenesis of endometriosis. Further studies to determine where and when these mutations occur and whether they can be used to develop the first biologically informed classification system for endometriosis are warranted. Copyright © 2018 Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0090,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of PathologyMême sujetEndometriosis Research and TreatmentTravaux en français237 207