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Enregistrement W2885006794 · doi:10.1080/07060661.2018.1504821

Virulence structure of<i>Magnaporthe oryzae</i>populations from Fujian Province, China

2018· article· en· W2885006794 sur OpenAlexvenueno aff
Niuniu Shi, Hongchun Ruan, Xian-Zhou Liu, Xiujuan Yang, Yuli Dai, Lin Gan, Furu Chen, Yixin Du

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirulenceBiologyVeterinary medicineGenePopulationCultivarGeneticsHorticultureMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rice blast, caused by Magnaporthe oryzae, is one of the most devastating diseases of rice worldwide. The aim of the present study was to elucidate the virulence structure of M. oryzae populations in Fujian Province, China, over the period 2006–2015. For this purpose, 456 M. oryzae isolates collected from diverse cultivars from eight rice cropping regions in Fujian were screened for the presence of 11 known avirulence genes: Avr-Pik, Avr-Pita1, Avr-Pita2, Avr-Pita3, PWL2, Avr1-CO39, ACE1, Avr-Piz-t, Avr-Pia, Avr-Pii and Avr-Pikm, with gene-specific molecular markers. The results showed that Avr-Pik and Avr-Pita3 occurred at the highest frequency (94.5% and 91.7%, respectively), while Avr1-CO39 and Avr-Pii were not detected. Further, the remaining avirulence genes occurred at frequencies ranging from 5.9% to 89.0%. Temporal population dynamics revealed that Avr-Pik was uniformly distributed in all 10 years, at frequencies of more than 87.5%. Spatial distribution analysis showed avirulence genes were present at different frequencies among the geographic regions. In addition, 24 rice monogenic lines of IRRI-Japan with known blast resistance genes were inoculated to assess the virulence of 60 isolates. The results revealed that the resistance gene Pik showed the broadest resistance spectrum to the isolates tested and therefore would be the most useful in rice blast resistance breeding. The resistance genes Pi-z5, Pi-1(1), Pi-kp, Pi-9(t), Pi-ta(1) and Pi-kh also were effective and would therefore also be of value to resistance breeding programmes. The present study provides information that should be useful for the development and deployment of rice blast resistant cultivars in Fujian Province.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,071

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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