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Enregistrement W2885057788 · doi:10.1038/s41380-018-0218-y

Genetics of suicide attempts in individuals with and without mental disorders: a population-based genome-wide association study

2018· article· en· W2885057788 sur OpenAlexaff
Annette Erlangsen, Vivek Appadurai, Yunpeng Wang, Gustavo Turecki, Ole Mors, Thomas Werge, Preben Bo Mortensen, Anna Starnawska, Anders D. Børglum, Andrew J. Schork, Ron Nudel, Marie Bækvad‐Hansen, Jonas Bybjerg‐Grauholm, David M. Hougaard, Wesley K. Thompson, Merete Nordentoft, Esben Agerbo

Notice bibliographique

RevueMolecular Psychiatry · 2018
Typearticle
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueSuicide and Self-Harm Studies
Établissements canadiensMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthLundbeckfondenH. Lundbeck A/SNovo Nordisk FondenNational Institute of General Medical SciencesNovo NordiskBroad Institute
Mots-clésGenome-wide association studyPsychiatric geneticsPsychiatryAssociation (psychology)Mental healthPsychologyGeneticsGenetic associationPopulationSchizophrenia (object-oriented programming)MedicineClinical psychologyBiologyGeneSingle-nucleotide polymorphismGenotypePsychotherapistEnvironmental health

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Family studies have shown an aggregation of suicidal behavior in families. Yet, molecular studies are needed to identify loci accounting for genetic heritability. We conducted a genome-wide association study and estimated single nucleotide polymorphisms (SNP) heritability for a suicide attempt. In a case-cohort study, national data on all individuals born in Denmark after 1981 and diagnosed with severe mental disorders prior to 2013 (n = 57,377) and individuals from the general population (n = 30,000) were obtained. After quality control, the sample consisted of 6024 cases with an incidence of suicide attempt and 44,240 controls with no record of a suicide attempt. Suggestive associations between SNPs, rs6880062 (p-value: 5.4 × 10−8) and rs6880461 (p-value: 9.5 × 10−8), and suicide attempt were identified when adjusting for socio-demographics. Adjusting for mental disorders, three significant associations, all on chromosome 20, were identified: rs4809706 (p-value: 2.8 × 10−8), rs4810824 (p-value: 3.5 × 10−8), and rs6019297 (p-value: 4.7 × 108). Sub-group analysis of cases with affective disorders revealed SNPs associated with suicide attempts when compared to the general population for gene PDE4B. All SNPs explained 4.6% [CI-95: 2.9–6.3%] of the variation in suicide attempt. Controlling for mental disorders reduced the heritability to 1.9% [CI-95: 0.3–3.5%]. Affective and autism spectrum disorders exhibited a SNP heritability of 5.6% [CI-95: 1.9–9.3%] and 9.6% [CI-95: 1.1–18.1%], respectively. Using the largest sample to date, we identified significant SNP associations with suicide attempts and support for a genetic transmission of suicide attempt, which might not solely be explained by mental disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,741

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations170
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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