Influence of a growth hormone transgene on the genetic architecture of growth‐related traits: A comparative analysis between transgenic and wild‐type coho salmon
Notice bibliographique
Résumé
Genetic engineering has been increasingly applied to many commercially important plant and animal species, generating phenotypic changes that are not observed in natural populations and creating genetic interactions that have not experienced natural selection. The degree to and way in which such human-induced genetic variation interacts with the rest of the genome is currently largely unknown. Integrating such information into ecological and risk assessment frameworks is crucial to understand the potential effects of genetically modified organisms in natural environments. Here, we performed QTL mapping to investigate the genetic architecture of growth-related traits in nontransgenic (NT) and growth hormone transgenic (T) coho salmon with large changes in growth and related physiology, with the aim of identifying how an inserted transgene might influence the opportunity for selection. These fish shared the same parental genetic background, thus allowing us to determine whether the same or different loci influence these traits within the two groups. The use of over 1,700 loci, derived from restriction site-associated DNA sequencing, revealed that different genomic regions were linked with growth over time between the two groups. Additionally, the effect sizes of detected QTL appear to have been influenced by the transgene. Direct comparison of QTL between the T and NT fish during two size-matched periods identified little overlap in their location. Taken together, the results showed that the transgene altered the genetic basis of growth-related traits in this species. The study has important implications for effective conservation and management of wild populations experiencing introduction of transgenes. Evolutionary changes and their ecological consequences may occur at different rates and in different directions in NT versus T individuals in response to selection. Thus, assessments of phenotypic change, and hence ecological risk, should be determined periodically to evaluate whether initial estimates made with founder strains remain valid.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».