Ecological niche modeling predicting the potential distribution of Leishmania vectors in the Mediterranean basin: impact of climate change
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: N. Recent studies show that some phlebotomine sand flies were recorded in several parts of Germany and Belgium. In central Europe, some autochthone leishmaniasis cases are being recorded in regions traditionally regarded as leishmaniasis-free. An important challenge is to predict the geographical distribution of leishmaniasis vectors under new climatic conditions. In this study, we attempted to predict the current distribution of six leishmaniasis vectors in the Mediterranean basin and forecast species' geographical shift under future climate scenarios using an ensemble ecological niche modeling approach. Species records were obtained from scientific surveys published in the research literature between 2006 and 2016. A series of climate metrics describing temperature and precipitation in the study area under two climatic scenarios were obtained from WorldClim database. A consensus model was derived from six varieties of modeling approaches (regression, machine learning and classification techniques) in order to ensure valid prediction of distribution of vectors under different climate scenarios. RESULTS: Model performance was generally high for the included species with a specificity (true negative rate) ranging from 81.03 to 96.52% (mean = 86.94%) and a sensitivity (true positive rate) ranging from 87.93 to 100% (mean = 96.98%). Our work evidenced the hypothesis of the widespread of Leishmania vectors under climate change scenarios. All of the studied species are prospected to gain new areas that are actually not suitable for vectors' survival. Phlebotomine sand flies are prospected to invade extra-Mediterranean regions, especially western and central Europe. CONCLUSIONS: Our study confirmed the importance of environmental and climate factors on the distribution of leishmaniasis vectors and demonstrated the performance of ecological niche modeling in the prediction of the geographical spread of vector-borne diseases. Ecological niche modeling should be considered in the future as a valuable tool in addition to experimental laboratory studies for a better understanding of the biology of vector species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».