A partly stage-structured model for the abundance of salmon lice in salmonid farms
Notice bibliographique
Résumé
The parasitic salmon louse constrains growth in the Norwegian salmon farming industry through density dependent host-parasite interaction. Hence, there is a need for insight into how increases in salmon production, varying spatial organisation of the production and pest control strategies affect salmon louse population dynamics. Here we present a new salmon louse model for exploring effects of varying salmon farming conditions on spatio-temporal abundances of the parasite. The salmon louse model is partly stage-structured, comprising of (i) adult female lice and (ii) other mobile stages of lice. The abundance of adult females depend on survival of females from previous weeks and recruitment from the other mobile group of lice. The other mobiles also depend on survival of other mobiles from previous weeks, as well as recruitment from the previous generation of reproducing adult females from the same farm or from farms in the neighbourhood. In addition, expected abundances of the two stage-groups are modelled as functions of biological and physical covariates. The model is fitted to weekly salmon farm data covering all marine farms producing salmonids along the Norwegian cost over the years 2012-2016. Among novel results from fitting the model are estimates of the time-lag structure representing recruitment of other mobile lice from the previous generation adult females for different temperatures. Furthermore, the model estimates how various factors affect the susceptibility of fish on farms to louse infection and effects of treatments to control infection. Finally, the model estimates density dependent effects of increasing the number of fish in farms and of increasing the numbers of farms, on the rate of recruitment of other mobile lice. Analytically, the parameters representing density dependencies suggest that few farms with many fish and large between farm distances is effective in terms of minimising the overall output of salmon lice infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».