MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2885458596 · doi:10.1158/1538-7445.am2018-5434

Abstract 5434: Screen for immune-related transcriptional targets of the Hippo pathway in human breast cancer cells

2018· article· en· W2885458596 sur OpenAlexaff
Helena J. Janse van Rensburg, Taha Azad, Yawei Hao, Lori M. Minassian, Brooke Snetsinger, Prem Khanal, Michael J. Rauh, Charles H. Graham, Xiaolong Yang

Notice bibliographique

RevueCancer Research · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHippo pathway signaling and YAP/TAZ
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHippo signaling pathwayImmune systemCancerCancer researchBiologyBreast cancerCancer cellTranscriptional regulationCTGFCell biologySignal transductionImmunologyTranscription factorGeneGeneticsGrowth factorReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The Hippo signaling pathway has recently emerged as a cellular network that is dysregulated in cancer. In breast cancer cells, aberrant activation of the Hippo transducers (and transcriptional co-activators) TAZ and YAP leads to altered expression of their downstream gene targets and endows cells with multiple “hallmarks of cancer”. While several transcriptional targets of TAZ and YAP underlying their pro-tumorigenic activity have been described (e.g. CTGF, CYR61), gene targets of TAZ and YAP that modulate immune cell behavior in the tumor microenvironment are poorly understood. We have performed a comprehensive screen for immune-related transcriptional targets of TAZ and YAP in human breast cells. We have identified many candidate genes that are potentially regulated by TAZ and YAP including the immune checkpoint molecules PD-L1 and PD-L2, the lymphocyte regulator S1PR1 and the inflammasome component NLRP3. We have further validated PD-L1 as a bona fide transcriptional target of TAZ and YAP. These findings reveal new functions for the Hippo pathway in modifying immune responses and implicate TAZ and YAP in cancer immune evasion. Citation Format: Helena J. Janse van Rensburg, Taha Azad, Min Ling, Yawei Hao, Lori M. Minassian, Brooke Snetsinger, Prem Khanal, Michael J. Rauh, Charles H. Graham, Xiaolong Yang. Screen for immune-related transcriptional targets of the Hippo pathway in human breast cancer cells [abstract]. In: Proceedings of the American Association for Cancer Research Annual Meeting 2018; 2018 Apr 14-18; Chicago, IL. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2018;78(13 Suppl):Abstract nr 5434.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,312 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer ResearchMême sujetHippo pathway signaling and YAP/TAZTravaux en français237 207