Design and implementation of a tool for conversion of search strategies between PubMed and Ovid MEDLINE
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Both PubMed and Ovid MEDLINE contain records from the MEDLINE database. However, there are subtle differences in content, functionality, and search syntax between the two. There are many instances in which researchers may wish to search both interfaces, such as when conducting supplementary searching for a systematic review to retrieve a unique content from PubMed or when using a previously published search strategy from a different interface, but little guidance on how to best conduct these searches. The aim of this project is to describe differences in search functionality between Ovid MEDLINE and PubMed, provide guidance for converting search strategies between the two, and develop an easy-to-use, freely available web-based tool to automate search syntax translations. CASE PRESENTATION: In this paper, we present a custom-built freely available online tool, Medline Transpose, to streamline the process of converting search strategies between Ovid MEDLINE and PubMed. With this tool, users can paste a strategy formatted for one interface into the search box and immediately retrieve an output formatted for use in the other interface, with recommendations for changes that users can make to the strategy where an exact translation does not exist. CONCLUSION: This novel approach has the potential to reduce time and errors that database users spend translating search strategies.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,043 | 0,119 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,014 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,007 | 0,007 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,039 | 0,016 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».