MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2885714594 · doi:10.1002/stem.2895

Molecular Programming of Perivascular Stem Cell Precursors

2018· article· en· W2885714594 sur OpenAlexfundno aff
Val Yianni, Paul T. Sharpe

Notice bibliographique

RevueStem Cells · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMesenchymal stem cell research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of OxfordMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchMedical Research Council CanadaWellcome Trust
Mots-clésBiologyStem cellCell biologyCellular differentiationStem cell markerStromal cellMesenchymal stem cellPericyteAdult stem cellCell typeCellEndothelial stem cellGeneticsCancer researchGeneIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pericytes have been shown to act as precursors of resident adult stem cells in stromal tissues in vivo. When expanded in vitro these cells are capable of giving rise to multiple mesenchymal cell types, irrespective of their tissue of origin. This phenomenon of multi-lineage differentiation is only observed in culture, whereas in vivo, stromal stem cell differentiation is restricted to tissue-specific cell types. An important unanswered question is how a single, widely distributed cell type (a pericyte) gives rise to stem cells with tissue-specific functions and attributes. Using a combination of transcriptomics and epigenomics we have compared the molecular status of two populations of stromal stem cell precursors. Using a LacZ transgene insertion that is expressed in pericytes but not in stem cells, we were able to compare pericyte populations from two different tissues, mouse incisors and bone marrow. Pericytes, freshly isolated from mouse incisors and bone marrow, exhibited transcriptomes and epigenetic landscapes that were extensively different, reflecting their tissue of origin and future in vivo differentiation potential. Dspp, an odontoblast differentiation gene, as well as additional odontogenic genes, are shown to be expressed in dental pulp-derived pericytes. These genetic loci are also decorated with histone modifications indicative of a transcriptionally active chromatin state. In bone marrow pericytes, a major osteogenic differentiation gene, Runx2, is not expressed but is marked by both active and repressive histones and therefore primed to be expressed. Polycomb repressor complex 1 analysis showed that key genes involved in the induction of adipogenesis, chondrogenesis, and myogenesis are targeted by Ring1b and therefore stably repressed. This indicates that pericyte populations are molecularly obstructed from differentiating down certain lineages in vivo. Stem Cells 2018;36:1890-15.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,059
Score d'incertitude au seuil0,813

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueStem CellsMême sujetMesenchymal stem cell researchTravaux en français237 207