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Enregistrement W2885744557 · doi:10.1186/s40168-018-0512-6

Trichoderma polysporum selectively inhibits white-nose syndrome fungal pathogen Pseudogymnoascus destructans amidst soil microbes

2018· article· en· W2885744557 sur OpenAlexaboutno aff
Amanpreet Singh, Erica Lasek‐Nesselquist, Vishnu Chaturvedi, Sudha Chaturvedi

Notice bibliographique

RevueMicrobiome · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesU.S. Fish and Wildlife ServiceNational Science Foundation
Mots-clésBiologyConidiumAscomycotaTrichodermaAcidobacteriaSoil microbiologyBotanyPopulationBasidiomycotaMicrobiologyProteobacteriaEcologySoil waterBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudogymnoascus destructans ( Pd ), the causative fungal agent of white-nose syndrome (WNS), has led to the deaths of millions of hibernating bats in the United States of America (USA) and Canada. Efficient strategies are needed to decontaminate Pd from the bat hibernacula to interrupt the disease transmission cycle without affecting the native microbes. Previously, we discovered a novel Trichoderma polysporum ( Tp ) strain (WPM 39143), which inhibited the growth of Pd in autoclaved soil samples. In the present investigation, we used culture-based approaches to determine Tp -induced killing of native and enriched Pd in the natural soil of two bat hibernacula. We also assessed the impact of Tp treatment on native microbial communities by metagenomics. Our results demonstrated that Tp at the concentration of 10 5 conidia/g soil caused 100% killing of native Pd in culture within 5 weeks of incubation. A 10-fold higher concentration of Tp (10 6 conidia/g soil) killed an enriched Pd population (10 5 conidia/g soil). The 12,507 fungal operational taxonomic units (OTUs, dominated by Ascomycota and Basidiomycota ) and 27,427 bacterial OTUs (dominated by Acidobacteria and Proteobacteria ) comprised the native soil microbes of the two bat hibernacula. No significant differences in fungal and bacterial relative abundances were observed between untreated and Tp -treated soil (10 5 Tp conidia/g soil, p ≤ 0.05). Our results suggest that Tp -induced killing of Pd is highly specific, with minimal to no impact on the indigenous microbes present in the soil samples. These findings provide the scientific rationale for the field trials of Tp in the WNS-affected hibernacula for the effective decontamination of Pd and the control of WNS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,782
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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