Concordance of “Case Level” Global, Highest, and Largest Volume Cancer Grade Group on Needle Biopsy Versus Grade Group on Radical Prostatectomy
Notice bibliographique
Résumé
The practice of assigning "case level" biopsy Grade Group (GG) or Gleason Score is variable. To our knowledge, a comparison of the concordance of different biopsy "case level" GG with the prostatectomy GG has not been done in a post-2005 prostate cancer cohort. We evaluated the GG in 2527 patients who had biopsy and radical prostatectomy performed at our institution between 2005 and 2014. We compared the agreements, the upgrades, and the downgrades of 3 different "case level" biopsy GG, with the final GG: (1) Global GG (sum of most prevalent and highest Gleason grade in any biopsy part/site-specific specimen); (2) Highest GG (found in any biopsy part/site-specific specimen); and (3) Largest Volume Cancer GG (found in any biopsy part/site-specific specimen). The concordance between the biopsy and the final GG were evaluated using weighted kappa (κ) coefficient. The biopsy Global GG, Highest GG, and Largest Volume Cancer GG were the same as the final GG in 60.4%, 57.1%, and 54.3% cases, respectively (weighted κ values: 0.49, 0.48, and 0.44, respectively). When final GG contained tertiary 5, the overall GG agreement decreased: Global GG 41.5%, Highest GG 40.3%, and Largest Volume Cancer GG 37.1% (weighted κ: 0.22, 0.21, and 0.18, respectively). A subset analysis for cases in which the biopsy Global GG and Highest GG were different (n=180) showed an agreement of 62.4% (weighted κ: 0.37) and 18.8% (weighted κ: 0.16), respectively. In patients without a tertiary Gleason pattern on radical prostatectomy, the Global GG and the Highest GG were identical in 92.4% of biopsies. Assigning a biopsy "case level" Global GG versus using the Highest GG and the Largest Volume Cancer GG resulted in comparable and slightly improved agreement with the final GG in this cohort.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».