MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2886038173 · doi:10.1101/392290

Identification of negative BOLD responses using windkessel models

2018· preprint· en· W2886038173 sur OpenAlexaff
Pedro A. Valdés-Hernández, Byron Bernal, Arash Moshkforoush, Catalina Dunoyer, Hui Ming Khoo, Jorge Bosch‐Bayard, Nicolás von Ellenrieder, Jean Gotman, Jorge Riera

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2018
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésNeuroscienceIdentification (biology)Computer sciencePsychologyArtificial intelligencePattern recognition (psychology)Biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Alongside positive BOLD responses (PBR), a variety of negative BOLD responses (NBR) with distinct underlying mechanisms also occur. We identify five mechanisms of NBR: i ) local/lateral/contralateral inhibition (LCI), ii ) neuronal disruption of network activity (NDA), iii ) altered balance of neuro-metabolic/vascular couplings (ANC), iv ) arterial blood stealing (ABS), and v ) venous blood backpressure (VBB). Detecting and classifying these mechanisms from BOLD signals is pivotal in understanding normal/pathological brain functions. This requires models and parameters with anatomical/functional interpretation that furnish the understanding of how these mechanisms are fingerprinted by their BOLD responses. Here, we used a windkessel model with viscoelastic compliance as well as dynamics of both neuronal and tissue/blood O 2 to investigate the generation, detection, classification and interpretation of the BOLD hemodynamic response functions (HRF) of above mechanisms. Firstly, we evaluated the use of the general linear model to detect simulated NBRs. Secondly, we tested the ability of a machine learning classifier, built from a simulated ensemble of HRFs, to predict the mechanism underlying a new HRF. Crossvalidation indicates NDA and ANC can accurately be classified solely from fMRI BOLD signals; while LCI, ABS and VBB might require additional imaging modalities. Thirdly, we demonstrated that estimators of the model parameters determinant in the NBRs formation are accurate, and precise to certain resolutions. Finally, we successfully applied our detection/classification/estimation methodology to EEG-fMRI data in a clinical situation where several of these mechanisms could coexist. We believe that the proper identification and interpretation of NBR mechanisms have important clinical and cognitive implications in fMRI studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetAdvanced MRI Techniques and Applications→Travaux en français237 207→