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Enregistrement W2886222140 · doi:10.1080/2162402x.2018.1486950

EBV infection determines the immune hallmarks of plasmablastic lymphoma

2018· article· en· W2886222140 sur OpenAlexfundno aff
Pauline Gravelle, Sarah Péricart, Marie Tosolini, Bettina Fabiani, Paul Coppo, Nadia Amara, Alexandra Traverse‐Glehen, Nathalie Van Acker, Pierre Brousset, Jean‐Jacques Fournié, Camille Laurent

Notice bibliographique

RevueOncoImmunology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral-associated cancers and disorders
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of Cancer ResearchInstitut National Du CancerInstitut Universitaire de FranceLigue Contre le CancerAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésPlasmablastic lymphomaImmune checkpointImmune systemLymphomaImmunologyMedicineTumor microenvironmentEpstein–Barr virusCytotoxic T cellImmunotherapyCancer researchVirusBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Despite recent therapeutic progress, plasmablastic lymphoma (PBL), a distinct entity of high grade B cell lymphoma, is still an aggressive lymphoma with adverse prognosis. PBL commonly occurs in patients with HIV infection and PBL cells frequently express Epstein Barr virus (EBV) genome with type I latency. Occasionally however, PBL may develop in patients with an immunodepressed status without EBV and HIV infection. The aim of this study was to determine which PBL patients may benefit from the emerging strategies of immune checkpoint blockade. Here, we produced and analyzed the transcriptomic profiles of such tumors to address this question. Unsupervised hierarchical clustering analysis of PBL samples revealed they segregate according to their tumor EBV-status. Moreover, EBV+ PBL displays abundant leucocyte infiltrates and T-cell activation signatures, together with high expression levels of mRNA and protein markers of immune escape. This suggests that EBV infection induce an anti-viral cytotoxic immunity which progressively exhausts T lymphocytes and promotes the tolerogenic microenvironment of PBL. Hence, most EBV+ PBL patients presenting an early stage of cancer immune-editing process appear as the most eligible patients for immune checkpoint blockade therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,771
Score d'incertitude au seuil0,322

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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